Sowohl im Stiftungsrat als auch im Vorstand und im Finanzausschuss der Stiftung ist die DKG auf der Seite der Leistungserbringer vertreten. Mitglieder des Vorstandes sind das Bundesministerium für Gesundheit, vertreten durch Herrn Staatssekretär Stroppe, der Gemeinsame Bundesausschuss, vertreten durch Herrn Hecken, die DKG (Herr Baum), die KBV (Herr Dr. Gassen), die KZBV (Herr Dr. Eßer) sowie der GKV-Spitzenverband (Frau Dr. Pfeiffer, Herr von Stackelberg, Herr Kiefer).

Das Institut für Qualität und Transparenz im Gesundheitswesen soll die im § 137a SGB V genannten Aufgaben zum 01.01.2016 übernehmen und damit das AQUA-Institut ablösen.